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硕士论文 5个绵羊品种GDF8区域8个微卫星的多态性及其与肉用性能的相关分析

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硕士论文-5个绵羊品种GDF8区域8个微卫星的多态性及其与肉用性能的相关分析,共58页,33001字
摘 要
根据绵羊的遗传图谱及相关报道,选择了 2 号染色体 GDF8 区域可能与肉用性能相
关性较大的 8 个高度多态微卫星基因座位(BM81124,TEXAN2,FCB128,BMS1591,
ILSTS30,FCB20,TGLA10,BMS678),分析这些位点在 陶赛特、萨福克和特克塞尔
三个肉羊品种的遗传变异,选择新疆当地品种中国美利奴(肉用多胎品系)和阿勒泰羊
作为对照。结果表明,8 个微卫星座位上共检测到 64 个等位基因,等位基因数在 5~12
个之间。各基因座多态信息含量为 0.4896~0.8937,均表现出了高度多态性。各基因座杂
和度为 0.5766~0.9022,说明这些绵羊品种有着较丰富的遗传多样性。5 个绵羊品种中,
3 个肉羊品种的遗传距离相对较近,陶赛特羊与萨福克羊遗传距离最近,为 0.1843。阿
勒泰羊与萨福克羊的遗传距离最远,为 0.3377。根据遗传距离进行系统聚类分析,准确
的反映了这 5 个绵羊群体的地理分布和它们的亲缘关系。研究结果对我国肉用绵羊资源
的评估、保存和预测杂种优势具有一定的指导意义。
8 个微卫星不同基因型与三个肉羊群体(陶赛特、萨福克和特克塞尔)进行肉用性
能的最小二乘分析,结果表明:FCB128 的基因型(139/122)对眼肌面积产生正面影响,
TEXAN2 的基因型(132/116 和 125/108)对臀宽产生正面影响,位点 FCB128 的基因
型(122/108 和 119/108)对背膘厚产生正影响。表明在微卫星(TEXAN2、FCB128 和
BM81124)三个位点基因座附近可能存在影响绵羊肉用性能的 QTL 位点。
关键词:绵羊;微卫星标记;多态性;肉用性能
目录
中文摘要……...……… . …………..i
英文摘要…………..…………........ . .……ii
前言…...…1
文献综述…………..……….………2
1 微卫星标记……...…………...………..……...2
1.1 微卫星的发现……...………...…… . ………2
1.2 微卫星的形成机制及筛选方法..... ...... 2
1.3 微卫星的结构……...…… ……3
1.4 微卫星标记的特点...... ...4
1.5 微卫星标记在绵羊遗传育种中的应用 .. …………5
1.6 微卫星标记方法的局限性和不足… .......... ………9
2 GDF8 基因的研究概况………….. ………….9
2.1 GDF8 基因的发现及结构… ......... …..9
2.2 GDF8 基因的作用机制……..........………… . …..10
2.3 GDF8 基因的定位 ..... 10
3 绵羊 GDF8 基因的研究进展以及课题的提出 .......... 11
3.1 绵羊 GDF8 基因的研究进展… ....... .11
3.2 本研究课题的提出.. ....... .........12
材料和方法..........…………..13
1 实验材料.........…………...13
1.1 耳组织样…….......13
1.2 主要试剂… ........ ………13
1.3 主要仪器……… ........ …15
2 主要实验步骤………… ........ ………...13
2.1 羊的臀宽的测定….……….. .. 13
2.2 活体羊的眼肌面积和背膘厚度测定 ........ ………13
2.3 组织样中 DNA 的提取………....... ...14
2.4 微卫星 DNA 标记的选择………......... ………….14
2.5 PCR 反应条件……….........………….15
2.6 聚丙烯酰胺凝胶制备与电泳………15
2.7 银染……… ....... ………16
2.8 基因型分型…… ....... ....16
3 数据统计分析………… ........ ………...16
3.1 等位基因频率… ..... …………16
3.2 多态信息含量 ..... 17
3.3 遗传杂合度.. .... ..17
3.4 有效等位基因数…… …17
3.5 遗传距离……… . ......17
3.6 聚类分析………… ……18
3.7 微卫星标记与肉用性能的相关分析18
结果与分析… ..... …..19
1 PCR 产物的 PAGE 检测…...……....…19
2 微卫星座位的多态性统计… ........ ………..……….21
2.1 各微卫星位点的等位基因个数、大小及频率………… ..... ……….…….21
2.2 各微卫星位点在不同绵羊品种中的多态信息含量、群体杂合度及有效等位基因
数........ 24
2.3 各群体间遗传距离及系统聚类图……… . ……..25
2.4 各微卫星座位不同基因型的最小二乘与显著性检验……… ......... ……..26
讨论…… ......... .29
1 试验分析技术.......... ........ ..........29
1.1 关于抽样和样本容量问题… ………29
1.2 关于引物的设计与选择问题… ........ …..………..29
1.3 PCR 反应体系与条件的确定…..……......... …….29
1.4 PCR 产物的检测……..…….. ……...30
1.5 关于基因型判断问题……… ....... …30
2 关于群体遗传变异分析 ………...……31
3 关于群体间的遗传距离与系统发生关系分析… ........ ……...…32
4 关于不同群体微卫星基因座的遗传特性的讨论………….……… ........ …..32
5 关于标记多态性与肉用性能的相关分析……… ........ ……...…32
6 关于本实验的创新点………… .. …...35
结论..........…… ........ ………36
参考文献………37
附录42
致谢…………....45


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论文格式:word
论文专业:动物遗传育种与繁殖
论文编号:198506
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